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删除空间 功能介绍 删除空间。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 参数解释:
更新空间 功能介绍 更新空间。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 参数解释: 空间ID。
去水:去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子:去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态,若上传的受体中包含配体,提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局”,可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”,进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的,选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。
使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL
是否必选 参数类型 描述 type 否 String 参数解释: 桶类型。 约束限制: 不涉及 取值范围: OBJECT:桶列表 PFS:并行文件系统 默认取值: 不涉及 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 参数解释:
如何使用Notebook的Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下,单击右上角“New”,然后选择“Terminal”,进入Terminal界面。 图1 Terminal 例如,您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。
导入、上传或同步镜像 镜像导入 镜像按照空间进行划分和管理,隶属于不同空间的镜像可以使用“导入”,导入到本空间中,进行使用。 使用“导入”功能,用户需是其他空间中的成员,且为其他空间的“所有者”或“管理员”。 单击“我的空间”,并选择“镜像”,进入镜像管理页面。 图1 镜像 单击
上传和下载数据 在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
移除空间成员 功能介绍 移除空间成员。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/members/{user_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
Notebook常用操作 打开Notebook 选择不同的AI引擎新建文件 编写文件 删除文件或文件夹 使用Notebook Terminal功能 打开Notebook 在Notebook列表中,选择已经创建的Notebook,单击操作列的“打开”,进入Notebook开发页面。
生物医药 提供生物医药领域华为自研和开源的多元化套件,支持用户进行训练、微调、推理等。 资产列表 表1 资产列表 领域 资产类型 资产名称 说明 生物医药 镜像 GenomeAgent 端到端自动化生物信息流程AI智能体,基于大模型的生物信息知识及代码生成能力,以提示词工程为框架自动编写任务计划和代码。
添加收藏 功能介绍 添加收藏。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/favorites 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 参数解释:
创建镜像 功能介绍 创建镜像。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/images 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String
ID):访问密钥ID。 --sk -s 是 SK(Secret Access Key):与访问密钥ID结合使用的密钥。 --region -r 是 服务区域名称。依据购买服务所在的区域进行选择,可选cn-east-3。 --platform-id -i 是 项目ID,获取方法请参见获取认证信息。 --iam-endpoint
String 参数解释: 显示名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 profile String 参数解释: 系统镜像名。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持PY3 默认取值: 不涉及 请求示例 获取notebook工作环境。 https://{e
配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷:是否加入离子,使体系电荷守恒,默认是平衡电荷。 蛋白力场:蛋白质力场支持amber03, amber94,
准备工作 注册华为账号并开通华为云,并进行账号实名认证。购买服务时,账号不能处于欠费或冻结状态。 购买服务时,需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型,可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号(IAM账号)。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签,则说明是子账号;没有“我的主账号”页签,则说明是主账号。
靶点发现 靶点口袋发现 靶点优化 父主题: 小分子药物设计
分子优化作业管理 创建分子优化作业 查询分子优化作业详情 父主题: 小分子药物设计
详细的操作命令请参见系统设置命令、空间管理命令、数据管理命令、镜像管理命令、应用管理命令、AI科学计算服务流程管理命令、AI科学计算服务作业管理命令或notebook命令章节。 查询操作命令列表。 执行ai4s --help查询支持的操作命令。Linux系统下,需添加./指定当前路径。