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编辑应用 您可以对已经创建的应用进行编辑,修改对应参数信息。 在应用列表页面,选择需要修改的应用,单击操作列“编辑”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面,可以修改相关的参数。相关参数描述可参考创建应用。 如果更改了版本号,相当于新建一个应用。 父主题: 应用
像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于AI科学计算服务控制台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像
表2 用户权限 用户角色 权限说明 系统管理员 拥有用户管理,绑定资源,以及修改系统设置相关权限。 非系统管理员 拥有查看权限,无权修改。 开通平台的账户为最终租户,该账户不可被删除。 最终租户可以创建子用户,并将子用户授权为系统管理员。系统管理员同样具备“用户管理”功能。 对于
Notebooks 提供生物医药领域华为自研和开源的多元化套件,支持用户进行训练、微调、推理等。 资产列表 表1 资产列表 领域 资产类型 资产名称 说明 生物医药 镜像 GenomeAgent 端到端自动化生物信息流程AI智能体,基于大模型的生物信息知识及代码生成能力,以提示词工程为框架自动编写任务计划和代码。
应用简介 AI科学计算服务控制台中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至AI科学计算服务控制台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“我的空
导入应用 导入应用是将隶属于其他空间的应用导入至本空间中,一次至多导入50个应用。 使用“导入”功能,用户需是其他空间中的成员,且为其他空间的“所有者”或“管理员”。 单击“导入”,进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的空间以及空间中的应用,选择应用的版本。“导入应用
yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在AI科学计算服务控制台新建应用过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app:
在cce集群中购买gpu资源,并且需要应用支持GPU运行。选择Snt9+ARM时,需要应用支持ARM环境运行,并在创建应用时,镜像系统为ARM类系统。 运行分析作业时,流程中的每一个应用称之为一个任务(Task),在编排流程时,如果“输出路径”修改为空,实际作业输出结果依然默认存
均可以使用收藏夹功能对结果进行收藏,以下以分子对接模块为例,其他模块的收藏操作可在相应模块的介绍中查阅,请参考功能模块。 登录AI科学计算服务控制台。 单击“资产市场 > 小分子药物设计 > 苗头化合物发现 > 分子对接”,进入分子对接配置页面。 根据分子对接章节完成参数配置。 分子对接任务完成后,单击“我的空间
yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在AI科学计算服务控制台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见命令行工具 > 流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理-
流程管理 发布流程 父主题: 应用管理
AI科学计算服务作为一个完备的AI开发平台,支持用户对其进行细粒度的权限配置,以达到精细化资源、权限管理之目的。 平台用户权限管理 AI科学计算服务支持两种类型的用户管理,可以帮助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 AI科学计算服务用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理
自定义镜像运行流程 场景描述 镜像简介 操作流程 配置命令行工具
移除空间成员的角色 使用delete命令删除空间成员的角色,并将成员移除空间。空间的所有者和管理员有权限执行该操作。 命令结构 ai4s delete member <member-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 member-name 无
删除数据作业 使用delete命令删除数据作业。 命令结构 ai4s delete data-job <data-job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 是 数据作业id。 --project 无 否 指定空间名。未填写则使用配置文件中的空间名。
填写CPU、Memory大小(内存单位为GB),选择GPU类型。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0
下载应用 进入“我的空间”页面“应用”页签,通过关键字搜索或过滤找到需要下载的应用。 图1 应用 单击操作列的“下载”即可下载应用。 图2 下载应用 下载内容不包含应用的id,所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题: 应用
分析流程至少由一个应用组成,在多个应用构成的流程中,一个应用的输出作为另一个应用的输入,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 AI科学计算服务控制台中的流程由应用搭建形成,应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 图1 流程 应用呈现的信息在创建应用过程中定义,包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
下载流程 在“我的空间”页面“流程”页签,通过输入流程名称找到需要下载的流程。 单击操作列的“下载”即可下载流程。 图1 下载 下载内容不包含流程的id,所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题: 流程
数据简介 AI科学计算服务控制台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按空间维度进行隔离和划分,从空间角度进行数据的管理,不同空间的数据可以通过“引用”实现跨空间使用。您可以在“我的空间”页面,“数据”页签中,完成数据的上传、导入、引用、复制等操作。