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药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
使用预置模型创建分子优化作业 场景描述 操作流程
如何在Notebook中安装外部库 在Jupyter Notebook中安装 例如,通过Jupyter Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中,选择“New”(新建),然后选择“TensorFlow-1
--log /root/demo/logo.png # 执行成功返回结果如下 set vendor logo successfully! 父主题: 系统设置命令
Notebooks Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 父主题: 开发生产
收藏资产 功能介绍 收藏资产。 URI PUT /v1/{project_id}/assets/{asset_id}/stars 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
取消收藏 功能介绍 取消收藏。 URI DELETE /v1/{project_id}/assets/{asset_id}/stars 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 asset_id 是 String 资产ID。 最小长度:1 最大长度:128 project_id
如何获取AK/SK AK/SK(Access Key ID/Secret Access Key)即访问密钥,包含访问密钥ID(AK)和秘密访问密钥(SK)两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 操作步骤
获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
恢复归档 功能介绍 将归档数据拷贝到目标空间的目录。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/backups/{backup_id}/restore 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型
自动作业管理 获取自动作业模板列表 创建自动作业模板 删除自动作业模板 更新自动作业模板 查询自动作业模板 启动自动作业 停止自动作业 父主题: 应用管理
药物作业管理 获取用户所属空间的药物作业列表 获取药物作业列表 取消药物作业 删除药物作业 更新药物作业 创建分子聚类作业 父主题: 小分子药物设计
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 在“资产市场 > 小分子药物设计”页面,单击“CPI预测”功能卡片的“立即使用”。 图1 立即使用 选择空间后,单击“确定”进入配置页面。支持在已有空间选择空间或者新建空间。
应用配置文件说明 AI科学计算服务控制台中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在AI科学计算服务控制台,创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行
流程设计器 分析流程至少由一个应用构成,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流,一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器,您可以拖拽工具到画布中,可视化连接各应用,指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流程设计器界面由资源栏和画布两部分构成。
Notebook简介 AI科学计算服务控制台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter N
使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。 curl
药物模型管理 获取基模型列表 创建模型 获取模型列表 更新药物模型 删除模型 父主题: 小分子药物设计
格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 AI科学计算服务使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、
notebook开发环境 获取用户所属空间的notebook列表 获取notebook列表 创建notebook 获取notebook详情 更新notebook 删除notebook 启停notebook 获取notebook鉴权信息 获取notebook工作环境 父主题: notebook开发环境