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创建分子对接作业 功能介绍 创建分子对接作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/docking 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id
CSS集群解绑 功能介绍 CSS集群解绑。 URI DELETE /v1/{project_id}/drug/css-clusters/{css_cluster_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
获取模型列表 功能介绍 获取模型列表。 URI GET /v1/{project_id}/drug-models 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数
更新药物模型 功能介绍 更新药物模型。 URI PUT /v1/{project_id}/drug-models/{model_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
获取并使用命令行工具ai4s-toolkit 步骤1:获取认证信息 步骤2:下载并安装命令行工具ai4s-toolkit 步骤3:初始化配置 步骤4:查看与执行操作命令
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法,将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 在“资产市场 > 小分子药物设计 > 聚类分析”页面单击“立即使用”。 图1 立即使用 选择空间后,单击“确定”进入配置页面。支持在已有空间选择空间或者新建空间。
配置命令行工具 步骤1:获取认证信息 步骤2:获取命令行工具 步骤3:初始化配置 父主题: 自定义镜像运行流程
使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL
分子搜索 可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 在“资产市场 > 小分子药物设计”页面,单击“分子搜索”功能卡片的“立即使用”。 图1 立即使用 选择空间后,单击“确定”进入配
束条件是target2_binding_energy。 您可以通过“上传靶点”,将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件,提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后,运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体 将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
查看执行结果 作业运行完成后,可以在“作业”页面,单击作业名称,查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在“作业”页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D等信息。 图1 输出结果-列表视图 输出
更新空间审计日志追踪器配置 功能介绍 更新空间审计日志追踪器配置。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/project-tracker 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id
更新自动作业模板 功能介绍 更新自动作业模板 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs/{auto_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
为什么下载的部分靶点文件,显示不完整 由于molstar插件自身问题,部分靶点文件中存在REMARK行,会导致受体展示不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示: 分子优化靶点设置界面,受体展示正常。 但是下载该靶点文件后,使用通用工具Mol 3D Vie
步骤2:获取Notebook基础镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于AI科学计算服务控制台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr
获取消息列表 功能介绍 从消息中心获取当前用户有权限查看的消息列表。 URI GET /v1/{project_id}/messages 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
获取扩容策略详情 功能介绍 获取扩容策略详情。 URI GET /v1/{project_id}/system/autoscaler/scale-out-policies/{id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
获取策略伸缩历史 功能介绍 获取策略伸缩历史。 URI GET /v1/{project_id}/system/autoscaler/scale-out-policies/{id}/histories 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
创建自动作业模板 功能介绍 创建自动作业模板。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
单分子文件格式转换 功能介绍 单分子文件格式转换。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/format-converter 表1 路径参数 参数 是否必选