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表4 NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称。 profile String 系统镜像名：PY3。 枚举值： PY3 请求示例 获取notebook工作环境。 https://{endpoint}/v1/{project
使用的IaaS、PaaS和SaaS类云服务内部的安全以及对租户定制配置进行安全有效的管理，包括但不限于虚拟网络、虚拟主机和访客虚拟机的操作系统，虚拟防火墙、API网关和高级安全服务，各项云服务，租户数据，以及身份账号和密钥管理等方面的安全配置。 图1 华为云安全责任共担模型 父主题：
license: "" ai4s get app -s 获取app.yaml模板，以yaml格式打印到控制台 app: # 系统唯一标识，由系统随机分配，说明如下： # 1. 通过文件创建app时(UI\CMD)，id必须为空，不允许指定 # 2. 通过文件修改ap
er环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，ECS如果为Linux操作系统，可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker
创建靶点口袋分子设计作业 功能介绍 创建靶点口袋分子设计作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design 表1 路径参数 参数 是否必选
使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh
notebook镜像，支持PY3或者指定空间中镜像（格式为SourceProjectName/ImageName:TagName）。 说明： 若选择PY3，则代表使用系统镜像创建notebook； 若选择SourceProjectName/ImageName:TagName，则代表使用自定义镜像创建notebook。
创建新空间2 创建桶的命名遵循obs桶命名规则： 需全局唯一，不能与已有的任何桶名称重复，包括其他用户创建的桶。用户删除桶后，立即创建同名桶或并行文件系统会创建失败，需要等待30分钟才能创建。 长度范围为3到63个字符，支持小写字母、数字、中划线（-）、英文句号（.）。 禁止两个英文句号（.）相邻，禁止英文句号（
workflow: # 处理规则同app id: xxxx # 可选 # 流程唯一标识，由系统随机分配 # 处理规则同app name: xxxx # 必选 # workflow名称
Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 空间 空间是AI科学计算服务的一个工作空间，可以在空间中存储数据，上传镜像和创建分析作
Insufficient memory。该场景表示当前集群中无充足的计算资源，可以根据实际需要提前结束掉其他作业或notebook来释放资源，也可以进入系统资源页面管理集群购买新节点。 其他场景可以联系服务技术支持解决。 图6 购买计算资源 场景3 作业投递后显示运行成功，但是根据日志分析作业有报错，也未能正确输出相关信息。
去水：去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子：去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态，若上传的受体中包含配体，提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局”，可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”，进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的，选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。
创建新空间2 创建桶的命名遵循obs桶命名规则： 需全局唯一，不能与已有的任何桶名称重复，包括其他用户创建的桶。用户删除桶后，立即创建同名桶或并行文件系统会创建失败，需要等待30分钟才能创建。 长度范围为3到63个字符，支持小写字母、数字、中划线（-）、英文句号（.）。 禁止两个英文句号（.）相邻，禁止英文句号（
查询靶点口袋分子设计作业详情 功能介绍 查询靶点口袋分子设计作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design/{job_id} 表1
配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷：是否加入离子，使体系电荷守恒，默认是平衡电荷。 蛋白力场：蛋白质力场支持amber03, amber94,
束条件是target2_binding_energy。 您可以通过“上传靶点”，将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件，提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后，运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体 将原始配体作为口袋位置，也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
上传受体：受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体：配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。 选择参考配体：当前自由能微扰支持自动规划路径，选择参考配体后系统自动计算，用户也可自主添加或删除配体对。 图3 上传文件 引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”，选择配体对。
每个工作空间在资产层面完全隔离，确保资产的安全性和操作的独立性，有效避免交叉干扰或权限错配带来的风险。 - 创建Notebook 平台支持系统镜像或自定义镜像创建Notebook。 您可以直接使用该Notebook，编写和调测模型，进行开发工作。 - 使用Notebook Jup
析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游分析或者优化等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。 图7 聚类分析 待聚类分析完成后，单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图8 查看聚类结果 在聚
建场景； # 其他场景，app_id为系统分配的唯一标识 display_name: '步骤1' # 流程的子任务展示名称，最大长度64
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