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受体预处理(Fasta格式) 功能介绍 受体预处理(Fasta格式),用于前端计算预期扣费次数 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess
订阅应用 功能介绍 订阅应用 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/subscribe 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是
去水:去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子:去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态,若上传的受体中包含配体,提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局",可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”,进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的,选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。
引用数据库或者导入数据到指定数据库 使用import命令引用数据库实例到当前所在项目或者导入数据到指定数据库。 命令结构 health import database instance <instance-id> [flags] 或者 health import db instance
创建靶点口袋分子设计作业 功能介绍 创建靶点口袋分子设计作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design 表1 路径参数 参数 是否必选
ebook来释放资源,也可以进入系统资源页面购买新节点。 0/4 nodes are available: XXX node(s) didn't match node selector。该场景表示当前集群中无计算资源满足标签要求,用户可以进入系统资源页面,选择节点,通过标签管理给节点添加标签。
获取子任务中实例的资源监控数据 功能介绍 获取子任务中实例的资源监控数据 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/tasks/{task_name}/instan
批量删除作业 功能介绍 批量删除作业 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/batch-delete 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
批量重试作业 功能介绍 批量重试作业 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/batch-retry 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
导入应用 功能介绍 批量导入应用 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/apps/batch-import 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
获取任务实例 使用get命令获取任务实例相关信息,如任务实例事件、任务实例详情。 命令结构 health get task <task-name> --job-id <job-id> --instance-name <instance-name> [flags] 表1 参数说明
获取数据库模板 使用get命令获取数据库模板列表、详情或者示例yaml文件。 命令结构 health get database template <template-id> [flags] 或者 health get db template <template-id> [flags]
创建数据库实例 使用create命令创建数据库实例。 命令结构 health create database instance <instance-name> [flags] 或者 health create db instance <instance-name> [flags]
获取作业日志 功能介绍 获取作业日志 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/logs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
创建自由能微扰作业 功能介绍 创建自由能微扰作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板,上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.tx
查询作业详情 使用get命令查询作业的详细信息,该命令同时可以用于获取作业模板。 命令结构 health get job ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有作业信息。 指定job-id时,列出具体作
步骤3:初始化配置 在使用命令行工具前,需要初始化配置信息,通过config命令对eihealth-toolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程,Linux和macOS环境配置过程相同。 方法1:使用账号、密码初始化 执行以下命令,进行初始化,命中的xxx和region信息请参考表2进行替换。
应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台,创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建
查询CPI作业详情 功能介绍 查询CPI作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/cpi/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id