检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用ai4s switch project命令进入到所需的空间中。 # 命令结构
与其他云服务的关系 统一身份认证服务(IAM) 统一身份认证(Identity and Access Management,简称IAM)是华为云提供权限管理的基础服务,可以帮助您安全地控制华为云服务和资源的访问权限。 AI科学计算服务使用IAM实现认证功能。 对象存储服务(OBS)
资产市场简介 资产市场是基于AI科学计算服务控制台构建的开发者生态社区,致力于提供科研、生物医药、化学材料、流体仿真等多个领域的华为自研及开源的多元化工具套件,包括小分子药物设计和Notebooks。旨在提供一个安全、开放的环境,促进资产的共享与使用,从而加速生物医药、基因组分析
云审计服务 云审计服务(Cloud Trace Service,CTS),是华为云安全解决方案中专业的日志审计服务,提供对各种云资源操作记录的收集、存储和查询功能,可用于支撑安全分析、合规审计、资源跟踪和问题定位等常见应用场景。 用户开通云审计服务并创建和配置追踪器后,CTS可记
创建靶点口袋分子设计作业 功能介绍 创建靶点口袋分子设计作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design 表1 路径参数 参数 是否必选
为什么下载的部分靶点文件,显示不完整 由于molstar插件自身问题,部分靶点文件中存在REMARK行,会导致受体展示不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示: 分子优化靶点设置界面,受体展示正常。 但是下载该靶点文件后,使用通用工具Mol 3D Vie
配置OBS访问权限 OBS服务 OBS全称Object Stroage Service(对象存储服务),提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力,可供用户存储任意类型和大小的数据。 宫颈癌细胞病理筛查API支持直接使用华为云OBS服务进行数据的存储,以减少服务使用成本,降低服务的响应时长,提升服务使用的体验。
表4 NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称。 profile String 系统镜像名:PY3。 枚举值: PY3 请求示例 获取notebook工作环境。 https://{endpoint}/v1/{project
查询靶点口袋分子设计作业详情 功能介绍 查询靶点口袋分子设计作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design/{job_id} 表1
workflow: # 处理规则同app id: xxxx # 可选 # 流程唯一标识,由系统随机分配 # 处理规则同app name: xxxx # 必选 # workflow名称
配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件:支持PDB格式文件,文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体,默认只处理第一个。 靶点预处理: 去配体:提交任务时系统会自动删除配体。 是否平衡电荷:是否加入离子,使体系电荷守恒,默认是平衡电荷。 蛋白力场:蛋白质力场支持amber03, amber94,
Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 空间 空间是AI科学计算服务的一个工作空间,可以在空间中存储数据,上传镜像和创建分析作
notebook镜像,支持PY3或者指定空间中镜像(格式为SourceProjectName/ImageName:TagName)。 说明: 若选择PY3,则代表使用系统镜像创建notebook; 若选择SourceProjectName/ImageName:TagName,则代表使用自定义镜像创建notebook。
最小长度:1 最大长度:128 image_tag String 镜像tag名。 最小长度:1 最大长度:64 profile String 系统镜像名:PY3。 枚举值: PY3 表9 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径。
最小长度:1 最大长度:128 image_tag String 镜像tag名。 最小长度:1 最大长度:64 profile String 系统镜像名:PY3。 枚举值: PY3 表7 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径。
最小长度:1 最大长度:128 image_tag String 镜像tag名。 最小长度:1 最大长度:64 profile String 系统镜像名:PY3。 枚举值: PY3 表9 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径。
API设计规范,如表1所示。 表1 AI科学计算服务API 类型 API 说明 空间管理 空间管理 空间创建、获取空间详情、删除空间等相关操作API。 系统管理 系统管理 系统资源、用户管理、标签等相关操作API。 镜像管理 镜像管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。 数据管理 数据管理
详细的操作命令请参见系统设置命令、空间管理命令、数据管理命令、镜像管理命令、应用管理命令、AI科学计算服务流程管理命令、AI科学计算服务作业管理命令或notebook命令章节。 查询操作命令列表。 执行ai4s --help查询支持的操作命令。Linux系统下,需添加./指定当前路径。
填写CPU、Memory大小(内存单位为GB),选择GPU类型。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0