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CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。 在“资产市场 > 小分子药物设计”页面,单击“CPI预测”功能卡片的“立即使用”。 图1 立即使用 选择空间后,单击“确定”进入配置页面。支持在已有空间选择空间或者新建空间。
约束限制: 不涉及 取值范围: 0-5.0 默认取值: 2 temperature 否 Float 参数解释: MD模拟的温度,单位K。
约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 请求示例 创建notebook,使用系统默认镜像,需要cpu资源1C,内存资源5G。
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取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 struct StructureConstraintParamsDto object 参数解释: 结构约束参数。
约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 picture String 参数解释: 资产封面图访问链接。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 create_time String 参数解释: 创建时间。
Notebook简介 AI科学计算平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook
取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 struct StructureConstraintParamsDto object 参数解释: 结构约束参数。
例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 空间 空间是AI科学计算服务的一个工作空间,可以在空间中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到空间中,并通过划分角色实现空间权限的划分。
产品功能 ai4s-toolkit提供了以下功能: 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签和系统资源,也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 空间管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移空间,也可以添加、修改、移除空间成员角色。
基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。
镜像简介 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。
系统管理 系统管理 系统资源、用户管理、标签等相关操作API。 镜像管理 空间管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。 数据管理 数据管理 数据管理相关操作API。 应用管理 应用管理 导入应用、创建应用、获取应用详情、删除应用等相关操作API。
详细的操作命令请参见系统设置命令、空间管理命令、数据管理命令、镜像管理命令、应用管理命令、AI科学计算服务流程管理命令、AI科学计算服务作业管理命令或notebook命令章节。 查询操作命令列表。 执行ai4s --help查询支持的操作命令。Linux系统下,需添加.
如果特殊字符中包含了双引号,需依据不同操作系统对特殊字符的规范来设置参数命令,例如: # 原镜像启动命令 bash -c "source activate my-rdkit-env && python adme.py --file_in ${file-in} --file_out
Token在计算机系统中代表令牌(临时)的意思,拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限。
表1 AI科学计算服务用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。 空间级别用户管理 资源级的角色配置,以空间为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便用户通过空间进行资源的访问、共享和协作。
创建配体相似性图计算任务 功能介绍 创建配体相似性图计算任务。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph 表1 路径参数
步骤2:获取命令行工具 下载命令行工具ai4s-toolkit 针对不同操作系统,ai4s-toolkit下载地址如下所示。
步骤2:下载并安装命令行工具ai4s-toolkit 下载命令行工具ai4s-toolkit 针对不同操作系统,ai4s-toolkit下载地址如下所示。